{"id":1902,"date":"2023-07-04T10:00:43","date_gmt":"2023-07-04T08:00:43","guid":{"rendered":"https:\/\/webs.uab.cat\/molbiomed\/2023\/07\/04\/pedro-martinez-defiende-su-trabajo-de-final-de-grado\/"},"modified":"2023-07-04T18:42:01","modified_gmt":"2023-07-04T16:42:01","slug":"pedro-martinez-defiende-su-trabajo-de-final-de-grado","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/webs.uab.cat\/molbiomed\/es\/2023\/07\/04\/pedro-martinez-defiende-su-trabajo-de-final-de-grado\/","title":{"rendered":"Pedro Mart\u00ednez defiende su Trabajo de Final de Grado"},"content":{"rendered":"\n
Exploring 14S-HpDHA binding modes and its negative allosteric modulation in hALOX12-catalyzed MaR1 biosynthesis<\/h5>\n\n\n\n

Pedro Mart\u00ednez Zaragoza<\/h4>\n\n\n\n

La respuesta inflamatoria est\u00e1 presente en un gran n\u00famero de enfermedades como defensa del cuerpo contra lesiones e infecciones. Generalmente consta de dos fases. En la primera se produce la bios\u00edntesis de sustancias como leucotrienos y prostaglandinas. A continuaci\u00f3n, tiene lugar la fase de resoluci\u00f3n de la inflamaci\u00f3n caracterizada por la bios\u00edntesis de mediadores lip\u00eddicos de la resoluci\u00f3n de la inflamaci\u00f3n (SPMs) como resolvinas, lipoxinas y maresinas. En muchos casos, esta segunda etapa no es efectiva y la inflamaci\u00f3n puede volverse cr\u00f3nica. Por este motivo, es necesario potenciar la bios\u00edntesis de SPMs.<\/h5>\n\n\n\n
Las lipoxigenas son una amplia familia de enzimas que participan activamente en las dos fases de los procesos inflamatorios. Se encargan de catalizar la hidroperoxidaci\u00f3n de \u00e1cidos grasos poliinsaturados de manera muy regio- y estereoespec\u00edfica. Recientemente, ha surgido un gran inter\u00e9s en la bios\u00edntesis de un potente SPM en el que est\u00e1 implicada la lipoxigenasa 12 de plaqueta humana: la maresina 1. Esta se inicia con la hidroperoxidaci\u00f3n del \u00e1cido docosahexaenoico, seguido de una epoxidaci\u00f3n y una hidr\u00f3lisis enzim\u00e1tica. Experimentalmente se ha observado que la etapa de epoxidaci\u00f3n compite con una segunda hidroperoxidaci\u00f3n regulada alost\u00e9ricamente.<\/h5>\n\n\n\n
\u00a1En esta investigaci\u00f3n se ha explorado esta v\u00eda competitiva mediante el uso de m\u00e9todos computacionales como el docking molecular y la din\u00e1mica molecular (MD) a partir de dos conformaciones diferentes de la prote\u00edna: estructuras abierta y cerrada. El punto de partida ha sido explorar las diferencias entre estas dos estructuras y c\u00f3mo afectan al modo de uni\u00f3n del ligando. La orientaci\u00f3n del ligando es un factor clave, ya que se postula que la v\u00eda competitiva debe tener lugar cuando este accede a la cavidad catal\u00edtica a trav\u00e9s del carboxilato. De esta manera, se han generado cuatro complejos como resultados de los c\u00e1lculos de docking.<\/h5>\n\n\n\n
La evoluci\u00f3n de estos sistemas se ha realizado a trav\u00e9s de simulaciones de din\u00e1mica molecular. En el an\u00e1lisis de las trayectorias, se ha hecho hincapi\u00e9 en aquellos par\u00e1metros directamente relacionados con la reactividad, como la orientaci\u00f3n del ligando respecto al cofactor de la enzima, as\u00ed como la distancia entre ellos. Estos resultados, junto con el an\u00e1lisis de t\u00faneles de acceso de ox\u00edgeno, indican que la v\u00eda competitiva se ve favorecida con la estructura abierta y el grupo carboxilato del ligando orientado hacia el interior de la cavidad catal\u00edtica.<\/h5>\n\n\n\n
<\/div>\n\n\n\n

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Imagen extra\u00edda de Mart\u00ednez, P. Exploring 14S-HpDHA binding modes and its negative allosteric modulation in hALOX12-catalyzed MaR1 biosynthesis (Treball de Fi de Grau). Universitat Aut\u00f2noma de Barcelona, 2023. <\/figcaption><\/figure>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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