{"id":653,"date":"2022-06-23T10:05:48","date_gmt":"2022-06-23T08:05:48","guid":{"rendered":"https:\/\/webs.uab.cat\/dmrqb\/?p=653"},"modified":"2023-04-17T11:17:19","modified_gmt":"2023-04-17T09:17:19","slug":"12th-congress-of-electronic-structure-principles-and-appilcations","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/webs.uab.cat\/molbiomed\/2022\/06\/23\/12th-congress-of-electronic-structure-principles-and-appilcations\/","title":{"rendered":"12th Congress of Electronic Structure Principles and Appilcations"},"content":{"rendered":"\n
Understanding how reticulocyte 15-lipoxygenase-1 catalyzes the production of lipoxins in the 5(S),15(S)-DiHpETE biosynthetic pathway<\/strong><\/h5>\n\n\n\n

\u00c0ngels Gonz\u00e1lez Lafont<\/a><\/em><\/strong><\/p>\n\n\n\n

La inflamaci\u00f3 aguda local dels organismes vius \u00e9s un mecanisme de defensa en resposta a una lesi\u00f3 tisular o contra una invasi\u00f3 de pat\u00f2gens microbians. Si es descontrola, evoluciona cap a una cr\u00f2nica i pot conduir a una \u00e0mplia gamma de malalties que es poden atribuir a una fallada de resoluci\u00f3. Per tant, els processos inflamatoris s\u00f3n un problema de salut de primer ordre.<\/h5>\n\n\n\n
Els mediadors lip\u00eddics especialitzats en pro-resoluci\u00f3 (SPM), que s\u00f3n mol\u00e8cules de senyalitzaci\u00f3 cel\u00b7lular formades a les c\u00e8l\u00b7lules pel metabolisme d’\u00e0cids grassos poliinsaturats, s\u00f3n crucials per provocar la resoluci\u00f3 de la inflamaci\u00f3 i, per tant, alleujar les malalties inflamat\u00f2ries cr\u00f2niques. 5S,6R,15S- Trihidroxi-7E,9E,11Z,13E-\u00e0cid eicosatetraenoic i 5S,14R,15S-trihidroxi-6E,8Z,10E,12E-\u00e0cid eicosatetraenoic van ser els primers SPM descoberts. Aquests productes s’anomenen lipoxina A4 (LXA4) i lipoxina B4 (LXB4), respectivament, i deriven de l’\u00e0cid araquid\u00f2nic. La bios\u00edntesi d’aquestes lipoxines (productes d’interacci\u00f3 lipoxigenasa) requereix cat\u00e0lisi per lipoxigenases (LOX).<\/h5>\n\n\n
\n
\"\"
\u00c0ngels Gonz\u00e1lez Lafont – ESPA2022, Vigo<\/figcaption><\/figure>\n<\/div>\n\n\n
En aquest estudi, pretenem avan\u00e7ar en la comprensi\u00f3 del mecanisme de formaci\u00f3 de lipoxines mitjan\u00e7ant la via biosint\u00e8tica 5(S),15(S)-diHpETE a nivell molecular. Amb aquest objectiu, hem combinat simulacions de din\u00e0mica molecular (MD) i c\u00e0lculs de mec\u00e0nica qu\u00e0ntica\/mec\u00e0nica molecular (QM\/MM) per explorar les diferents reaccions que el reticul\u00f2cit 15-LOX-1 pot catalitzar quan 5(S),15(S) -diHpETE o 5(S),15(S)-diHETE actua com a substrat.<\/h5>\n\n\n\n
Els nostres resultats no prediuen la formaci\u00f3 de lipoxines mitjan\u00e7ant el mecanisme de deshidrataci\u00f3. Aquest resultat \u00e9s compatible amb el fet que no s’ha detectat cap ep\u00f2xid directament com a intermediari en la formaci\u00f3 catal\u00edtica de lipoxines a partir de 5(S),15(S)-diHpETE. La formaci\u00f3 de lipoxines t\u00e9 lloc mitjan\u00e7ant l’addici\u00f3 de la mol\u00e8cula d’oxigen als radicals \u03c0 nonatetraenil derivats de 5(S),15(S)-diHpETE per l’abstracci\u00f3 d’hidrogen C10. L’addici\u00f3 d’oxigen antarafacial a C14 \u00e9s molt f\u00e0cil, donant lloc posteriorment a la formaci\u00f3 de LXB4. Tanmateix, l’addici\u00f3 de la mol\u00e8cula d’oxigen a C6 est\u00e0 bloquejada per C4 de 5(S),15(S)-diHpETE i les cadenes laterals de Leu408 i Leu597. Tamb\u00e9 hi ha una important reorganitzaci\u00f3 de C6 i C7 per ajustar-se a l’entrada d’oxigen a C6. Aquesta \u00e9s la ra\u00f3 per la qual LXA4 no es pot formar a partir de 5(S),15(S)-diHpETE per 15-LOX-1<\/h5>\n\n\n\n
Per comparaci\u00f3, tamb\u00e9 hem estudiat el comportament de 5(S),15(S)-diHETE com a substrat. En aquest cas, l’addici\u00f3 d’oxigen a C14 no \u00e9s factible i no existeix cap canal d’acc\u00e9s a l’oxigen que condueixi a C6. En conseq\u00fc\u00e8ncia, el 15-LOX-1 no pot convertir el 5(S),15(S)-diHETE en una lipoxina, cosa que est\u00e0 d’acord amb els resultats experimental.<\/h5>\n\n\n\n
<\/div>\n\n\n\n
The production of lipoxins in the 5(S),15(S)-DiHpETE biosynthetic pathway. A combined Molecular Dynamics and QM\/MM study<\/strong><\/strong><\/h5>\n\n\n\n

Alejandro Cruz S\u00e1ez<\/a><\/em><\/strong><\/p>\n\n\n\n

En aquest treball, hem combinat simulacions de din\u00e0mica molecular (MD) i c\u00e0lculs de mec\u00e0nica qu\u00e0ntica\/mec\u00e0nica molecular (QM\/MM) per analitzar com el reticulocit 15-LOX-1 catalitza la producci\u00f3 de lipoxines a partir de 5(S),15(S)- diHpETE. <\/h5>\n\n\n\n
Ara es reconeix \u00e0mpliament que la inflamaci\u00f3 cr\u00f2nica t\u00e9 un paper important en moltes malalties freq\u00fcents, inclosa la COVID-19. La resposta de resoluci\u00f3 a aquesta inflamaci\u00f3 cr\u00f2nica \u00e9s un proc\u00e9s actiu governat per mediadors pro-resoluci\u00f3 (SPM) especialitzats com els mediadors lip\u00eddics coneguts com lipoxines. La bios\u00edntesi de lipoxines est\u00e0 catalitzada per diverses lipoxigenases (LOX) de l’\u00e0cid araquid\u00f2nic. Tanmateix, els detalls moleculars dels mecanismes implicats encara no s\u00f3n ben coneguts. <\/h5>\n\n\n\n
Els nostres resultats indiquen que el mecanisme de deshidrataci\u00f3 del 5(S),15(S)-diHpETE, mitjan\u00e7ant la formaci\u00f3 d’un ep\u00f2xid, presenta enormes barreres energ\u00e8tiques tot i que era una de les dues propostes sint\u00e8tiques a priori. Aquest resultat \u00e9s compatible amb el fet que no s’ha detectat cap ep\u00f2xid directament com a intermedi en la formaci\u00f3 catal\u00edtica de lipoxines a partir de 5(S),15(S)-diHpETE. Per contra, l’oxigenaci\u00f3 de 5(S),15(S)-diHpETE a C14 \u00e9s factible perqu\u00e8 hi ha un canal obert que connecta la superf\u00edcie de la prote\u00efna amb aquest \u00e0tom de carboni i la barrera energ\u00e8tica per a l’addici\u00f3 d’oxigen a trav\u00e9s d’aquest canal \u00e9s petita. L’an\u00e0lisi dels passos seg\u00fcents d’aquest mecanisme, que condueixen a l’hidroper\u00f2xid corresponent al lloc actiu 15-LOX-1, indica que el mecanisme d’oxigenaci\u00f3 conduir\u00e0 a la formaci\u00f3 de la lipoxina B4 despr\u00e9s de l’acci\u00f3 final d’una reductasa. <\/h5>\n\n\n\n
En canvi, els nostres c\u00e0lculs estan d’acord amb els experiments que la lipoxina A4 no pot derivar de 5(S),15(S)-diHpETE per cap dels dos mecanismes proposats i que 5(S),15(S)-diHETE no \u00e9s un intermedi de la bios\u00edntesi de lipoxines catalitzada per 15-LOX-1.<\/h5>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Understanding how reticulocyte 15-lipoxygenase-1 catalyzes the production of lipoxins in the 5(S),15(S)-DiHpETE biosynthetic pathway \u00c0ngels Gonz\u00e1lez Lafont La inflamaci\u00f3 aguda local dels organismes vius \u00e9s un mecanisme de defensa en resposta a una lesi\u00f3 tisular o contra una invasi\u00f3 de pat\u00f2gens microbians. Si es descontrola, evoluciona cap a una cr\u00f2nica i pot conduir a una […]<\/p>\n","protected":false},"author":2580,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[40,37,34,65],"tags":[23,42,41,33],"class_list":["post-653","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-congressos","category-lipoxigenases","category-noticies","category-poster","tag-congres","tag-espa","tag-lipoxigenases","tag-xerrada"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/webs.uab.cat\/molbiomed\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/653","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/webs.uab.cat\/molbiomed\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/webs.uab.cat\/molbiomed\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/webs.uab.cat\/molbiomed\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2580"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/webs.uab.cat\/molbiomed\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=653"}],"version-history":[{"count":6,"href":"https:\/\/webs.uab.cat\/molbiomed\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/653\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1723,"href":"https:\/\/webs.uab.cat\/molbiomed\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/653\/revisions\/1723"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/webs.uab.cat\/molbiomed\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=653"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/webs.uab.cat\/molbiomed\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=653"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/webs.uab.cat\/molbiomed\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=653"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}