Software

Easy MD Analysis (EMDA)

Easy MD Analysis (EMDA) es un paquete de Python basado en MDAnalysis creado con el objetivo de proporcionar una forma sencilla pero potente de realizar análisis de simulaciones MD.

Si desea utilizarlo, haga clic aquí.

RCBS.py

RCBS.py (Reactivity of Chemical and Biochemical Systems) es un paquete Python que contiene varios scripts, funciones y clases que simplifican el análisis de simulaciones químicas y bioquímicas.

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AMBER parameters

Repositorio para colocar archivos de parámetros y cargas (frcmod y mol2) de los sustratos utilizados en nuestro laboratorio. Todos los archivos disponibles se distribuyen en carpetas en función de si corresponden a una enzima, sustrato o la combinación de ambos a partir de una simulación de ensamblaje.

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