Software

Easy MD Analysis (EMDA)

Easy MD Analysis (EMDA) és un paquet de Python basat en MDAnalysis creat amb l’objectiu de proporcionar una manera fàcil però potent de realitzar anàlisis de simulacions MD.

Si el voleu utilitzar, feu clic aquí.

RCBS.py

RCBS.py (Reactivity of Chemical and Biochemical Systems) és un paquet Python que conté diversos scripts, funcions i classes que simplifiquen l’anàlisi de simulacions químiques i bioquímiques.

Si el voleu utilitzar, feu clic aquí.

AMBER parameters

Repositori per col·locar fitxers de paràmetres i càrregues (frcmod i mol2) dels substrats utilitzats al nostre laboratori. Tots els fitxers disponibles es distribueixen en carpetes en funció de si corresponen a un enzim, substrat o la combinació d’ambdós a partir d’una simulació d’acoblament.

Si el voleu utilitzar, feu clic aquí.