Malgrat que les restes de fauna trobades a les excavacions de Llívia no són, fins ara, importants en quantitat, si que proporcionen una informació valuosa sobre les espècies animals i la transhumància d’aquesta regió pirenaica. Per aquesta raó, el seu estudi l’està realitzant la Lídia Coromines (ICAC) per comparar les varietats animals consumides a la ciutat amb d’altres jaciments de la Cerdanya i de zones de l’Empordà.
Com a cas excepcional, es va trobar a la zona del peristil del fòrum una petita fosa amb l’enterrament d’un macaco, de marcat caràcter simbòlic, datat en el segle V-VI dC (Olesti et alii, 2013). Es tracta del primer enterrament d’aquestes característiques a la Península Ibèrica, que podria ser la mascota d’algun destacament militar tardoantic.